Monitorar a diversidade presente nos ambientes recifais brasileiros é fundamental para diagnosticar a saúde destes ecossistemas. Atualmente, a introdução de espécies exóticas através do comércio marítimo está entre as principais causas da perda da biodiversidade. Portos são considerados epicentros de invasões e, por isso, são áreas prioritárias de monitoramento. Nesse projeto, daremos início ao uso do DNA ambiental como ferramenta para inventariação da biodiversidade recifal brasileira e identificação de espécies exóticas ao longo de áreas portuárias e ilhas oceânicas. Este método utiliza rastros de DNA presentes no ambiente para detectar as espécies associadas a ele. Os resultados permitem gerar identificações precoces e aumentar as chances de erradicação. O uso associado de estruturas autônomas de monitoramento permitirá atingir diagnóstico inédito sobre os principais pontos de invasão no Brasil.