Muitas questões ainda não foram respondidas em epigenética, incluindo o papel da modulação da estrutura da cromatina (e suas marcas epigenéticas) em relação à regulação transcricional. Investigaremos esta questão usando um modelo celular eucariótico simples, o Trypanosoma cruzi. Além de ter um importante apelo médico na América Latina, nestes organismos não há regulação transcricional gene-específica para a maioria dos transcritos, o que nos permite visualizar os efeitos da dinâmica do epigenoma sem a interferência da regulação transcricional. Marcas epigenéticas e alterações globais na estrutura da cromatina já foram descritas em tripanossomas, e há evidências de serem moduladas na diferenciação celular. Estudaremos o epigenoma ao longo da diferenciação celular das formas epimastigotas para tripomastigotas metacíclicos utilizando Gro-seq, Faire-seq e proteômica quantitativa. A integração dos resultados permitirá elucidar questões importantes no campo da epigenética.